日前，世界衛(wèi)生組織正式宣布將新型冠狀病毒肺炎（COVID-19）命名為2019年冠狀病毒病（COVID-19）。負(fù)責(zé)病毒命名的國際學(xué)術(shù)機(jī)構(gòu)國際病毒分類委員會(huì)（ICTV）宣布，新型冠狀病毒的名稱已正式確定為SARS冠狀病毒-2（嚴(yán)重急性呼吸綜合征冠狀病毒2，SARS-CoV）。 -2）。

來源：ICTV官網(wǎng)首頁截圖

起初有些困惑的人們越來越困惑：既然新冠病毒多次與SARS脫節(jié)，為何國際權(quán)威ICTV突然將其稱為SARS-CoV-2？我們?nèi)绾卫斫馀cSARS相關(guān)的冠狀病毒？

本文將從冠狀病毒分類學(xué)的角度向您解釋新型冠狀病毒、SARS冠狀病毒和SARS相關(guān)冠狀病毒之間的關(guān)系。

1. SARS相關(guān)冠狀病毒是冠狀病毒科的一個(gè)病毒種

自然界中的病毒豐富多樣，但并不混亂?？茖W(xué)家根據(jù)病毒的遺傳信息和進(jìn)化關(guān)系對(duì)不同的病毒進(jìn)行分類。這是病毒分類學(xué)學(xué)科的工作。當(dāng)一種新病毒出現(xiàn)時(shí)，研究人員將根據(jù)特定規(guī)則，并根據(jù)目、科、屬、種等不同分類水平，使用該病毒的基因組序列。依次識(shí)別病毒。國際病毒分類委員會(huì)（ICTV）是病毒分類的權(quán)威組織。

我們先來了解一下冠狀病毒的分類。冠狀病毒科是巢病毒目下的一個(gè)病毒科，可進(jìn)一步分為冠狀病毒亞科和托羅病毒亞科。我們通常所說的冠狀病毒并不是指某種特定的病毒，而是冠狀病毒亞科所有成員的統(tǒng)稱。在2012年發(fā)布的ICTV第九次病毒分類報(bào)告中，我們可以看到冠狀病毒亞科分為四個(gè)屬：甲型冠狀病毒、乙型冠狀病毒、丙型冠狀病毒和乙型冠狀病毒，其中這兩個(gè)屬的甲型和乙型冠狀病毒主要感染哺乳動(dòng)物和所有人類冠狀病毒都位于這兩個(gè)屬中。 冠狀病毒屬可進(jìn)一步分為A、B、C、D四個(gè)系（譜系）。其中，B譜系只有一種病毒種（種）—— SARS相關(guān)冠狀病毒，即SARS相關(guān)冠狀病毒。

冠狀病毒亞科成員之間的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系（圖片引自國際病毒分類委員會(huì)第九次報(bào)告，ICTV，2012）

八年來，MERS冠狀病毒在中東地區(qū)暴發(fā)。除人類冠狀病毒外，越來越多的動(dòng)物冠狀病毒，特別是蝙蝠冠狀病毒被發(fā)現(xiàn)，冠狀病毒家族中又增添了許多新成員。最新ICTV第10期病毒分類報(bào)告正在持續(xù)更新中。盡管冠狀病毒分類報(bào)告的章節(jié)尚未正式發(fā)布，但I(xiàn)CTV在2018年發(fā)布了關(guān)于冠狀病毒分類的新提案（2017.013S），其中包括了冠狀病毒。病毒種類數(shù)量較之前顯著增加。具體看Betacoronavirus屬，在ICTV的新提案中，Betacoronavirus所屬的冠狀病毒種類從原來的7種增加到12種，而這12種分別屬于5個(gè)不同的亞屬（Sub-genus）。例如，梅貝克病毒亞屬包括四個(gè)種：MERS相關(guān)冠狀病毒、刺猬冠狀病毒1型、鳴翅冠狀病毒HKU5和平頭蝙蝠冠狀病毒HKU4。 Sarbecovirus亞屬對(duì)應(yīng)于先前分類建議中的B系Beta冠狀病毒，僅包括SARS相關(guān)冠狀病毒。

亞屬

代表病毒Embecovirus冠狀病毒1（Betacoronavirus 1）

人類冠狀病毒OC43 (HCoV OC43)、牛冠狀病毒、馬冠狀病毒

人類冠狀病毒HKU1

人類冠狀病毒HKU1 (HCoV HKU1) 小鼠冠狀病毒(鼠冠狀病毒)

鼠肝炎病毒(MHV) 中國鼠冠狀病毒HKU24

中國鼠冠狀病毒HKU24（ChRCoV HKU24） Merbecovirus 刺猬冠狀病毒1（刺猬冠狀病毒1）

歐洲刺猬冠狀病毒(EriCoV) MERS 相關(guān)冠狀病毒

中東呼吸綜合征冠狀病毒(MERS-CoV) Pipistrellus 蝙蝠冠狀病毒HKU5

蝙蝠冠狀病毒HKU5 (Pi-BatCoV HKU5) Tylonycteris 蝙蝠冠狀病毒HKU4

蝙蝠冠狀病毒HKU4 (Ty-BatCoV HKU4) Nobecovirus 果蝠冠狀病毒GCCDC1 (Rousettus 蝙蝠冠狀病毒GCCDC1)

蝙蝠冠狀病毒GCCDC1 (Ro-BatCoV GCCDC1) 果蝠冠狀病毒HKU9 (Rousettus 蝙蝠冠狀病毒HKU9)

蝙蝠冠狀病毒HKU9（Ro-BatCoV HKU9） SarbecovirusSARS相關(guān)冠狀病毒（SARS相關(guān)冠狀病毒）

嚴(yán)重急性呼吸系統(tǒng)綜合癥（SARS）冠狀病毒（SARS-CoV）

HibecovirusHp-betacoronavirus浙江2013（Bat Hp-betacoronavirus浙江2013）

蹄蝠乙型冠狀病毒（Bat_Hp-BetaCoV）是乙型冠狀病毒屬12個(gè)病毒種中的代表性病毒（引自ICTV冠狀病毒分類提案2018a文件號(hào)2017.013S）

物種是一個(gè)分類學(xué)概念，又進(jìn)一步細(xì)分。每種冠狀病毒物種都包含一種或多種代表性病毒。例如，2003年引起SARS的SARS冠狀病毒就是SARS相關(guān)冠狀病毒種的代表成員。人類冠狀病毒OC43是冠狀病毒1種的代表病毒。

看完以上內(nèi)容，相信大家對(duì)冠狀病毒尤其是Beta冠狀病毒的分類有了一定的了解。那么問題來了，新型冠狀病毒屬于哪一個(gè)病毒種呢？它是否代表一種新的冠狀病毒物種？

2、新型冠狀病毒屬于SARS相關(guān)冠狀病毒種。

要確定一個(gè)新病毒在分類學(xué)上屬于現(xiàn)有病毒種還是屬于全新病毒種，需要參考ICTV病毒分類規(guī)則。對(duì)于不同科的病毒，種屬鑒定的規(guī)則是不同的。就冠狀病毒而言，需要比較新病毒和已知病毒在ORF1ab 編碼的非結(jié)構(gòu)蛋白上的序列同一性。具體來說，非結(jié)構(gòu)蛋白上的七個(gè)保守復(fù)制酶結(jié)構(gòu)域?qū)τ诠跔畈《镜淖R(shí)別至關(guān)重要。這七個(gè)結(jié)構(gòu)域是：ADRP（腺苷二磷酸核糖-1"-磷酸酶），位于nsp3、nsp5（3CLpro，3C 主要蛋白酶）、nsp12（RdRp，RNA 依賴性RNA 聚合酶）、nsp13（Hel，解旋酶）、nsp14（ExoN） ICTV在其第九次分類報(bào)告中提出的分類規(guī)則：將七個(gè)復(fù)制酶結(jié)構(gòu)域的氨基酸序列串聯(lián)起來。如果兩種冠狀病毒之間的序列同一性大于90%閾值，則意味著有兩種冠狀病毒屬于同一物種。

雖然新型冠狀病毒和SARS冠狀病毒的基因組有20%左右的差異，但它們的ORF1b相對(duì)高度保守，并且ORF1b編碼的非結(jié)構(gòu)蛋白占據(jù)了上述7個(gè)復(fù)制酶結(jié)構(gòu)域的大部分。經(jīng)比對(duì)，新型冠狀病毒與SARS冠狀病毒在這7個(gè)結(jié)構(gòu)域的氨基酸序列相似度達(dá)到94%。因此，根據(jù)ICTV的冠狀病毒分類規(guī)則，新型冠狀病毒和SARS冠狀病毒屬于同一病毒種，即SARS相關(guān)冠狀病毒。

新型冠狀病毒與SARS冠狀病毒7個(gè)保守復(fù)制酶結(jié)構(gòu)域氨基酸序列比較

在公布新冠病毒名稱的同時(shí)，ICTV在BioRxiv上發(fā)布了題為《嚴(yán)重急性呼吸綜合征相關(guān)冠狀病毒：種及其病毒——冠狀病毒研究組聲明》的研究論文預(yù)印本。 ICTV冠狀病毒研究團(tuán)隊(duì)根據(jù)冠狀病毒ORF1a和1b的5個(gè)最保守的復(fù)制酶蛋白結(jié)構(gòu)域進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育分析，計(jì)算出兩個(gè)共同祖先之間的遺傳距離，確定新冠病毒和SARS冠狀病毒屬于SARS相關(guān)的同一物種冠狀病毒。并將新型冠狀病毒命名為SARS冠狀病毒-2。

3.新型冠狀病毒不是SARS冠狀病毒

既然被歸為同一物種，是否意味著新冠病毒SARS-CoV-2與SARS冠狀病毒非常相似，是第二種SARS病毒？不能這樣理解。同一冠狀病毒物種可能包含多種不同的病毒。例如，屬于冠狀病毒1種的病毒，除了人冠狀病毒OC43之外，還包括牛冠狀病毒、馬冠狀病毒、豬血凝腦脊髓炎病毒等多種病毒。 ICTV還在其預(yù)印本論文中明確提到，SARS-CoV-2是“SARS相關(guān)冠狀病毒種的SARS-CoV的姐妹”，即SARS-CoV-2和SARS冠狀病毒是姐妹。它們不能混為一談。

新型冠狀病毒和SARS病毒有一些相似之處：都可以引起重癥肺炎、都與野生動(dòng)物有關(guān)、發(fā)生季節(jié)相似，但它們的差異也很明顯。新冠病毒和SARS病毒的全長基因組序列相似度只有80%左右。冠狀病毒的S基因編碼負(fù)責(zé)受體結(jié)合的刺突蛋白，與病毒的致病性密切相關(guān)。然而，新型冠狀病毒與SARS病毒的S基因序列相似度僅為73%。從這一點(diǎn)來看，新冠病毒與SARS病毒還是有不少區(qū)別的。這些差異也導(dǎo)致了不同的致病生物學(xué)特性：與SARS病毒相比，新冠病毒的致病性只能是弟弟，而且可以發(fā)展成重癥。發(fā)病率和病死率比SARS低很多，但其傳播能力比SARS強(qiáng)。而且，新型冠狀病毒比SARS病毒更加狡猾，潛伏期更長。

由此我們可以看出，新型冠狀病毒和SARS病毒有很多明顯的區(qū)別，是兩個(gè)不同的東西。世界衛(wèi)生組織也在其官網(wǎng)解釋：2019-nCoV與SARS-CoV屬于同一病毒科，但不是同一種病毒，明確新型冠狀病毒和SARS病毒是不同的病毒。

截圖來源：世界衛(wèi)生組織官網(wǎng)

（https://www.who.int/news-room/q-a-detail/q-a-coronaviruses）

如果說冠狀病毒科是一個(gè)大家族，那么與SARS相關(guān)的冠狀病毒就是大家族中的一個(gè)小家族。但這個(gè)家庭有很多成員。除SARS冠狀病毒和新型冠狀病毒外，SARS相關(guān)冠狀病毒還包括在我國及全球多個(gè)地區(qū)的蝙蝠中發(fā)現(xiàn)的豐富多樣的類SARS冠狀病毒。從SARS相關(guān)冠狀病毒的進(jìn)化樹上我們可以看到，新型冠狀病毒和SARS冠狀病毒處于兩個(gè)不同的分支上，不同的蝙蝠SARS樣冠狀病毒也分布在這兩個(gè)分支上。進(jìn)化樹還直觀地表明，新冠病毒并不是SARS冠狀病毒的進(jìn)化或變異版本，也不是SARS 2.0，而是與SARS冠狀病毒有平行關(guān)系。

基于SARS相關(guān)冠狀病毒全長基因組序列的系統(tǒng)發(fā)育樹（Zhou et al. Nature, 2020）

也許有人會(huì)問：“你這里說ICTV認(rèn)定新冠病毒和SARS病毒是同一物種，但專家卻說新冠病毒和SARS病毒不是同一種病毒，這不是矛盾嗎？誰？”我應(yīng)該相信嗎？”事實(shí)上，這兩種說法都是正確的。據(jù)稱，新型冠狀病毒和SARS病毒是同一物種。這里的“種”指的是“種”，是分類學(xué)上的專有名詞。當(dāng)說新冠病毒和SARS不是同一種病毒時(shí)，這里的“種”是我們通俗的說法。這就好比說吉娃娃和泰迪不是同一種狗，但它們都是狗的品種。所以，這兩種說法都沒有問題。

最后，我們簡單總結(jié)一下新型冠狀病毒SARS-CoV-2和SARS冠狀病毒之間的關(guān)系：從分類學(xué)上來說，它們屬于同一冠狀病毒種，但卻是兩種不同的病毒。它們是一小群與SARS 相關(guān)的冠狀病毒。家里有兩個(gè)兄弟。

參考：

[1] Zhou P et al.2020。與可能源自蝙蝠的新型冠狀病毒相關(guān)的肺炎爆發(fā)。 Nature，doi: https://doi.org/10.1038/s41586-020-2012-7。[2]病毒分類、病毒分類和命名： 國際病毒分類委員會(huì)第九次報(bào)告。圣地亞哥，CA: 學(xué)術(shù)出版社，2012 年。[3]戈?duì)柊蛡悂咥E。 2020。嚴(yán)重急性呼吸綜合征相關(guān)冠狀病毒——物種及其病毒，冠狀病毒研究組的聲明。 BioRxiv，doi: https://doi.org/10.1101/2020.02.07.937862。

作者：胡奔（中國科學(xué)院武漢病毒研究所）