1842年11月，薄嘉回到中國，但機(jī)會又離他而去。薄嘉此時面對的中國和他離開時的中國已經(jīng)不同了。偉大勝利后，英國于1842年8月與中國簽訂第《南京條約》號協(xié)定：五個主要通商口岸（廈門、廣州、福州、寧波、上海）向英國人開放居住，允許英國人在此進(jìn)行貿(mào)易，并派遣人員至這五個主要貿(mào)易口岸。取消廣州舊華商的貿(mào)易壟斷權(quán)，割讓香港，支付巨額賠償，建立適當(dāng)統(tǒng)一的進(jìn)出口關(guān)稅。戰(zhàn)爭也留下了慘痛的后果，大多數(shù)中國人都很難接受這個條約。鴉片戰(zhàn)爭期間，廣州當(dāng)?shù)厥考澤縿尤诵纳钐幍呐磐馇榫w，令廣州人民尤為憤怒。當(dāng)?shù)厥考澬麚P(yáng)廣州人民不是被英國人打敗而是被自己的官員陰險(xiǎn)背叛的神話，并散布外國人威脅經(jīng)濟(jì)穩(wěn)定和女性貞操的神話。 1841年，一位紳士發(fā)出告示說：“我們已經(jīng)說過了，我們永遠(yuǎn)不會反悔。我們必須殺掉你，我們必須砍掉你，我們必須燒死你！我請人出謀劃策，但我沒有遵循：我必須把你剝下來?！?“吃皮吃肉，就知道我們的利益了?！奔词惯@只是廣州的排外情緒，但畢竟已經(jīng)夠危險(xiǎn)了，局勢還在沸騰，雖然洋人有條約做后盾，他們?nèi)匀粺o法進(jìn)入廣州城，甚至連洋行的安全都令人擔(dān)憂。1842年12月，暴亂爆發(fā)，伯嘉的妻子隨丈夫前往廣州，仍要尋找一個安全的地方暴民燒殺搶掠生意時卻躲藏起來。暴力總是追隨騷亂的腳步，循環(huán)不斷，一直持續(xù)到1840年代。伯嘉克服重重困難，繼續(xù)行醫(yī)，但內(nèi)心的滿足感已不再是所用。是：“上帝憐憫我，把我召回到我有用的地方，在那里我表現(xiàn)得比別人更好。人們對我的醫(yī)術(shù)的需求量很大，甚至更甚。比以往任何時候都好。王子、貴族、商人、走卒都需要我的照顧；但是，啊！我多么渴望能夠直接拯救他們的靈魂?。　?844年，美國駐華首任正部級全權(quán)公使顧勝蔭聘請薄嘉擔(dān)任美國特派使團(tuán)團(tuán)長。當(dāng)時的中國人還不夠好，無法寫中文官方文件，所以他必須將口頭文本翻譯成中文，然后讓一個不精通英語的助手起草官方文件。他只是遺憾自己不得不“暫時放下手頭的傳教工作”，并與顧勝、齊英商議，起草了《望廈條約》。根據(jù)這份條約，美國享有英國在1842年不流血奪取的權(quán)益?？紤]到薄伽的工作性質(zhì)，美國部于1845年決定不再資助他。這個決定對薄伽是一個很大的打擊。薄嘉的密友和崇拜者都熱切地為他辯護(hù)。兩種意見混合在一起。一是“醫(yī)生本人是一名傳教士，這使得他的醫(yī)院變成了教堂”。薄嘉不理會這些紛爭，一頭扎進(jìn)外交事務(wù)。隨著貿(mào)易和傳教擴(kuò)張的據(jù)點(diǎn)從廣州擴(kuò)展到新的通商口岸，中外關(guān)系變得越來越困難。薄嘉一上任，就參與平定1846年的動亂，他對中國人的行為越來越不能容忍，堅(jiān)決支持英國人采取果斷措施，捍衛(wèi)在華外國人的權(quán)利和人身安全。伯嘉的新職位也增加了他的財(cái)富和權(quán)力。美國新任總統(tǒng)富蘭克林·皮爾斯任命羅伯特·麥克萊恩為駐華公使，麥克萊恩奉命陪同代表團(tuán)前往北京修改條約。談判過程毫無成果，薄嘉心力交瘁，只得前往澳門休息。

1855年，伯嘉辭去工作回到美國，但美國仍然需要他的貢獻(xiàn)。 1856年，應(yīng)皮爾斯總統(tǒng)請求，薄嘉以美國公使身份再次抵達(dá)中國，奉命向清廷施壓，贏得美國外交。代表們有權(quán)在北京居住并“無限擴(kuò)大貿(mào)易往來”。薄家迫切希望與英法締結(jié)“三國同盟”，有效向中國人施壓。但英國外交官約翰·鮑林爵士認(rèn)為博雅的想法“異想天開、不切實(shí)際”，并百般阻撓博雅的工作。薄嘉的努力不僅白費(fèi)了，而且他不妥協(xié)的態(tài)度還為他樹立了新的敵人。薄嘉的美國外交官同事認(rèn)為他傲慢且優(yōu)柔寡斷。中國官員形容薄嘉“狡猾”、“可惡”、“頑固”。中國皇帝意識到薄嘉的好斗本性，稱其“別有用心”。法國大使形容薄嘉“身材高大，五十歲左右，步態(tài)端莊，體態(tài)臃腫，相貌粗俗，思維敏捷，心計(jì)多，深不可測”。沮喪和孤立加深了薄嘉對中國人的憤怒。薄家所描述的中國人“自然是推卸責(zé)任，謊話連篇，曲解條約，這是欽差大臣多年來所面對的一個特點(diǎn)”。最后，薄家呼吁美國政府占領(lǐng)臺灣，以與英國在新加坡和香港的據(jù)點(diǎn)保持力量平衡：“我希望美國政府在與臺灣的關(guān)系上不要向前看、向后看。美國政府的針對臺灣的行動關(guān)系到人性、文明、航海和商業(yè)利益，特別是占領(lǐng)臺灣東南部地區(qū)的不文明的藏族人民?！逼査箍偨y(tǒng)本來就對薄嘉有戒心，于1857年將他召回。薄嘉在美國游手好閑三十多年，于1888年去世，享年八十四歲。今年恰逢中華醫(yī)學(xué)布道會成立50周年。五十年來，中華醫(yī)學(xué)會所屬各醫(yī)療機(jī)構(gòu)已救治約百萬中國患者，取得了前所未有的醫(yī)療成就。數(shù)十名中國醫(yī)生在這里接受過西方醫(yī)學(xué)教育。薄嘉行醫(yī)多年，精通中文。他想讓中國“因上帝的榮耀而解放”。沒想到，他仍然限于專業(yè)技能，無法抑制對自己應(yīng)該愛的人的憤怒。