日前，世界衛(wèi)生組織正式宣布將新型冠狀病毒肺炎（COVID-19）命名為2019年冠狀病毒病（COVID-19）。負責病毒命名的國際學術(shù)機構(gòu)國際病毒分類委員會（ICTV）宣布，新型冠狀病毒的名稱已正式確定為SARS冠狀病毒-2（嚴重急性呼吸綜合征冠狀病毒2，SARS-CoV）。 -2）。

來源：ICTV官網(wǎng)首頁截圖

起初有些困惑的人們越來越困惑：既然新冠病毒多次與SARS脫節(jié)，為何國際權(quán)威ICTV突然將其稱為SARS-CoV-2？我們?nèi)绾卫斫馀cSARS相關(guān)的冠狀病毒？

本文將從冠狀病毒分類學的角度向您解釋，新型冠狀病毒、SARS冠狀病毒、SARS相關(guān)冠狀病毒之間到底是什么關(guān)系。

1. SARS相關(guān)冠狀病毒是冠狀病毒科的一個病毒種

自然界中的病毒豐富多樣，但并不混亂?？茖W家根據(jù)病毒的遺傳信息和進化關(guān)系對不同的病毒進行分類。這是病毒分類學學科的工作。當一種新病毒出現(xiàn)時，研究人員將根據(jù)特定的規(guī)則，并根據(jù)目、科、屬、種等不同的分類水平，使用該病毒的基因組序列。依次識別病毒。國際病毒分類委員會（ICTV）是病毒分類的權(quán)威組織。

我們先來了解一下冠狀病毒的分類。冠狀病毒科是巢病毒目下的一個病毒科，可進一步分為冠狀病毒亞科和托羅病毒亞科。我們通常所說的冠狀病毒并不是指某種特定的病毒，而是冠狀病毒亞科所有成員的統(tǒng)稱。在2012年發(fā)布的ICTV第九次病毒分類報告中，我們可以看到冠狀病毒亞科分為四個屬：甲型冠狀病毒、乙型冠狀病毒、丙型冠狀病毒和乙型冠狀病毒，其中這兩個屬的甲型和乙型冠狀病毒主要感染哺乳動物和所有人類冠狀病毒都位于這兩個屬中。 冠狀病毒屬可進一步分為A、B、C、D四個系（譜系）。其中，B譜系只有一種病毒種（種）—— SARS相關(guān)冠狀病毒，即SARS相關(guān)冠狀病毒。

冠狀病毒亞科成員之間的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系（圖片引自國際病毒分類委員會第九次報告，ICTV，2012）

八年來，MERS冠狀病毒在中東地區(qū)暴發(fā)。除人類冠狀病毒外，越來越多的動物冠狀病毒，特別是蝙蝠冠狀病毒被發(fā)現(xiàn)，冠狀病毒家族中又增添了許多新成員。最新ICTV第10期病毒分類報告正在持續(xù)更新中。盡管冠狀病毒分類報告的章節(jié)尚未正式發(fā)布，但ICTV在2018年發(fā)布了關(guān)于冠狀病毒分類的新提案（2017.013S），其中包括了冠狀病毒。病毒種類數(shù)量比以前顯著增加。具體來看Betacoronavirus屬，在ICTV的新提案中，Betacoronavirus所屬的冠狀病毒物種數(shù)量從原來的7種增加到了12種，而這12種分別屬于5個不同的亞屬（Sub-genus）。例如，Merbecovirus亞屬包括四個種：MERS相關(guān)冠狀病毒、刺猬冠狀病毒1、翼剪冠狀病毒HKU5和平頭蝙蝠冠狀病毒HKU4。 Sarbecovirus亞屬對應(yīng)之前分類建議中的B系Beta冠狀病毒，僅包括SARS相關(guān)冠狀病毒。

亞屬

代表病毒Embecovirus冠狀病毒1（Betacoronavirus 1）

人類冠狀病毒OC43 (HCoV OC43)、牛冠狀病毒、馬冠狀病毒

人類冠狀病毒HKU1

人類冠狀病毒HKU1 (HCoV HKU1) 小鼠冠狀病毒(鼠冠狀病毒)

鼠肝炎病毒(MHV) 中國鼠冠狀病毒HKU24

中國鼠冠狀病毒HKU24（ChRCoV HKU24） Merbecovirus 刺猬冠狀病毒1（刺猬冠狀病毒1）

歐洲刺猬冠狀病毒（EriCoV） MERS相關(guān)冠狀病毒（MERS相關(guān)冠狀病毒）

中東呼吸綜合征冠狀病毒(MERS-CoV) Pipistrellus 蝙蝠冠狀病毒HKU5

蝙蝠冠狀病毒HKU5 (Pi-BatCoV HKU5) Tylonycteris 蝙蝠冠狀病毒HKU4

蝙蝠冠狀病毒HKU4 (Ty-BatCoV HKU4) Nobecovirus 果蝠冠狀病毒GCCDC1 (Rousettus 蝙蝠冠狀病毒GCCDC1)

蝙蝠冠狀病毒GCCDC1 (Ro-BatCoV GCCDC1) 果蝠冠狀病毒HKU9 (Rousettus 蝙蝠冠狀病毒HKU9)

蝙蝠冠狀病毒HKU9（Ro-BatCoV HKU9） SarbecovirusSARS相關(guān)冠狀病毒（SARS相關(guān)冠狀病毒）

嚴重急性呼吸綜合征（SARS）冠狀病毒（SARS-CoV）

HibecovirusHp-betacoronavirus浙江2013（Bat Hp-betacoronavirus Zhouhe2013）

蹄蝠冠狀病毒（Bat_Hp-BetaCoV）是冠狀病毒屬12個病毒種中的代表性病毒（引自ICTV冠狀病毒分類提案2018a，文件號2017.013S）

物種是一個分類學概念，又進一步細分。每種冠狀病毒物種都包含一種或多種代表性病毒。例如，2003年引起SARS的SARS冠狀病毒就是SARS相關(guān)冠狀病毒種的代表成員。人類冠狀病毒OC43是冠狀病毒1種的代表病毒。

看完以上內(nèi)容，相信大家對冠狀病毒，尤其是Beta冠狀病毒的分類有了一定的了解。那么問題來了，新型冠狀病毒屬于哪一個病毒種呢？它是否代表一種新的冠狀病毒物種？

2、新型冠狀病毒屬于SARS相關(guān)冠狀病毒種。

要確定一個新病毒在分類學上屬于現(xiàn)有病毒種還是屬于全新病毒種，需要參考ICTV病毒分類規(guī)則。對于不同科的病毒，種屬鑒定的規(guī)則是不同的。就冠狀病毒而言，需要比較新病毒和已知病毒在ORF1ab 編碼的非結(jié)構(gòu)蛋白上的序列同一性。具體來說，非結(jié)構(gòu)蛋白上的七個保守復(fù)制酶結(jié)構(gòu)域?qū)τ诠跔畈《镜淖R別至關(guān)重要。這七個結(jié)構(gòu)域是：ADRP（腺苷二磷酸核糖-1"-磷酸酶），位于nsp3、nsp5（3CLpro，3C主要蛋白酶）、nsp12（RdRp，RNA依賴性RNA聚合酶）、nsp13（Hel，解旋酶）、nsp14（ExoN） ICTV在其第九次分類報告中提出的分類規(guī)則：將七個復(fù)制酶結(jié)構(gòu)域的氨基酸序列串聯(lián)起來。如果兩種冠狀病毒之間的序列同一性大于90%閾值，則意味著有兩種冠狀病毒屬于同一物種。

雖然新型冠狀病毒和SARS冠狀病毒的基因組有20%左右的差異，但它們的ORF1b相對高度保守，并且ORF1b編碼的非結(jié)構(gòu)蛋白占據(jù)了上述7個復(fù)制酶結(jié)構(gòu)域的大部分。經(jīng)比對，新型冠狀病毒與SARS冠狀病毒在這7個結(jié)構(gòu)域的氨基酸序列相似度達到94%。因此，根據(jù)ICTV的冠狀病毒分類規(guī)則，新型冠狀病毒和SARS冠狀病毒屬于同一病毒種，即SARS相關(guān)冠狀病毒。

新型冠狀病毒與SARS冠狀病毒7個保守復(fù)制酶結(jié)構(gòu)域氨基酸序列比較

在公布新冠病毒名稱的同時，ICTV在BioRxiv上發(fā)布了題為《嚴重急性呼吸綜合征相關(guān)冠狀病毒：種及其病毒——冠狀病毒研究組聲明》的研究論文預(yù)印本。 ICTV冠狀病毒研究小組根據(jù)冠狀病毒ORF1a和1b的5個最保守的復(fù)制酶蛋白結(jié)構(gòu)域進行系統(tǒng)發(fā)育分析，計算出兩個共同祖先之間的遺傳距離，確定新型冠狀病毒和SARS冠狀病毒屬于SARS相關(guān)的同一物種冠狀病毒。并將新型冠狀病毒命名為SARS冠狀病毒-2。

3.新型冠狀病毒不是SARS冠狀病毒

既然被歸為同一物種，是否意味著新冠病毒SARS-CoV-2與SARS冠狀病毒非常相似，是第二種SARS病毒？不能這樣理解。同一冠狀病毒物種可能包含多種不同的病毒。例如，屬于冠狀病毒1種的病毒，除了人冠狀病毒OC43之外，還包括牛冠狀病毒、馬冠狀病毒、豬血凝腦脊髓炎病毒等多種病毒。 ICTV還在其預(yù)印本論文中明確提到，SARS-CoV-2是“SARS相關(guān)冠狀病毒種的SARS-CoV的姐妹”，即SARS-CoV-2和SARS冠狀病毒是姐妹。它們不能混為一談。

新型冠狀病毒和SARS病毒有一些相似之處：都可以引起重癥肺炎、都與野生動物有關(guān)、發(fā)生季節(jié)相似，但它們的差異也很明顯。新冠病毒和SARS病毒的全長基因組序列相似度只有80%左右。冠狀病毒的S基因編碼負責受體結(jié)合的刺突蛋白，與病毒的致病性密切相關(guān)。然而，新型冠狀病毒與SARS病毒的S基因序列相似度僅為73%。從這一點來看，新冠病毒與SARS病毒還是有不少區(qū)別的。這些差異也導(dǎo)致了不同的致病生物學特性：與SARS病毒相比，新冠病毒的致病性只能是弟弟，而且可以發(fā)展成重癥。發(fā)病率和病死率比SARS低很多，但其傳播能力比SARS強。而且，新型冠狀病毒比SARS病毒更加狡猾，潛伏期更長。

由此我們可以看出，新型冠狀病毒和SARS病毒有很多明顯的區(qū)別，是兩個不同的東西。世界衛(wèi)生組織也在其官網(wǎng)解釋：2019-nCoV與SARS-CoV屬于同一病毒科，但不是同一種病毒，明確新型冠狀病毒和SARS病毒是不同的病毒。

截圖來源：世界衛(wèi)生組織官網(wǎng)

（https://www.who.int/news-room/q-a-detail/q-a-coronaviruses）

如果說冠狀病毒科是一個大家族，那么與SARS相關(guān)的冠狀病毒就是大家族中的一個小家族。但這個家庭有很多成員。除SARS冠狀病毒和新型冠狀病毒外，SARS相關(guān)冠狀病毒還包括在我國及全球多個地區(qū)的蝙蝠中發(fā)現(xiàn)的豐富多樣的類SARS冠狀病毒。從SARS相關(guān)冠狀病毒的進化樹上我們可以看到，新型冠狀病毒和SARS冠狀病毒處于兩個不同的分支上，不同的蝙蝠SARS樣冠狀病毒也分布在這兩個分支上。進化樹還直觀地表明，新冠病毒并不是SARS冠狀病毒的進化或變異版本，也不是SARS 2.0，而是與SARS冠狀病毒有平行關(guān)系。

基于SARS相關(guān)冠狀病毒全長基因組序列的系統(tǒng)發(fā)育樹（Zhou et al. Nature, 2020）

也許有人會問：“你這里說ICTV認定新冠病毒和SARS病毒是同一物種，但專家卻說新冠病毒和SARS病毒不是同一種病毒，這不是矛盾嗎？誰？”我應(yīng)該相信嗎？”事實上，這兩種說法都是正確的。據(jù)稱，新型冠狀病毒和SARS病毒是同一物種。這里的“種”指的是“種”，是分類學上的專有名詞。當說新冠病毒和SARS不是同一種病毒時，這里的“種”是我們通俗的說法。這就好比說吉娃娃和泰迪不是同一種狗，但它們都是狗的品種。所以，這兩種說法都沒有問題。

最后，我們簡單總結(jié)一下新型冠狀病毒SARS-CoV-2和SARS冠狀病毒的關(guān)系：在分類學上，它們屬于同一冠狀病毒種，但卻是兩種不同的病毒。它們是一小群與SARS 相關(guān)的冠狀病毒。家里有兩個兄弟。

參考：

[1] Zhou P et al.2020。與可能源自蝙蝠的新型冠狀病毒相關(guān)的肺炎爆發(fā)。 Nature，doi: https://doi.org/10.1038/s41586-020-2012-7。[2]病毒分類、病毒分類和命名： 國際病毒分類委員會第九次報告。圣地亞哥，CA: 學術(shù)出版社，2012 年。[3]戈爾巴倫亞AE。 2020。嚴重急性呼吸綜合征相關(guān)冠狀病毒——物種及其病毒，冠狀病毒研究組的聲明。 BioRxiv，doi: https://doi.org/10.1101/2020.02.07.937862。

作者：胡奔（中國科學院武漢病毒研究所）